Platforma介绍
Platforma是一款专为NGS数据分析打造的无代码生物信息学平台，由MiLaboratories开发，聚焦抗体、TCR及肽类发现全流程。它整合体外（如噬菌体/酵母展示）与体内（如免疫接种+单细胞测序）发现路径，在统一、透明、可审计的白盒环境中完成克隆型分析、富集计算、SHM谱系追踪、结构建模与风险评估。基于成熟工具MiXCR和MMSeqs2构建，支持十亿级序列处理，无需编程即可将原始测序数据转化为结构多样、开发潜力高、功能明确的先导分子候选集，真正赋能湿实验科学家独立完成复杂计算分析。
Platforma的主要功能
- 端到端无代码交互式分析流程
- 支持体外与体内抗体发现双模式分析
- 基于MiXCR的高精度V(D)J注释与克隆型识别
- 大规模CDR/框架区驱动的结构聚类
- 可视化SHM谱系树与胚系追溯
- 抗原特异性富集分析（含阴性对照校正）
- 序列与结构层面的开发风险自动标注
- 三维抗体建模与paratope表面特征评估
- 多组学数据（单细胞+转录组+免疫组库）融合分析
Platforma如何使用
- 在本地服务器或私有云环境部署Platforma平台
- 上传原始NGS数据（如10x VDJ、单细胞或文库测序文件）
- 选择预置分析模块或按实验设计配置自定义流程
- 运行自动化分析，实时查看克隆型注释、富集变化与SHM树
- 交互式浏览抗体空间地图，叠加功能数据筛选候选分子
- 导出排序后的先导分子列表及结构模型用于下游验证
Platforma的应用场景
- 噬菌体/酵母展示文库的多轮筛选与真结合子识别
- 天然免疫组库解析与稀有高亲和力抗体发现
- 单细胞BCR配对+多组学整合的转化医学研究
- TCR/BCR组库信号与患者临床结局关联分析
- 肽展示文库富集动态追踪与候选肽优选
- 基于knob-in-hole等技术的双/三特异性抗体设计
- DMS、pH-switch等新型筛选策略的数据标准化分析
